请联系主办方进行认证,即可解锁访问限制。
为了不影响召集报名,请您进行认证,即可解锁访问限制。
11月北京分子动力学模拟GROMACS初级培训班
该主办方未认证,请注意风险防范!
{{list.startDate}} ~ {{list.overDate}}
{{list.overDate}}结束
{{list.startDate}}开始
票种
-
免费 ¥{{toDecimal2(item.price)}} {{item.name}} ¥{{ toDecimal2(item.plusPrice) }} 优惠码减免¥{{item.discountMoney}} 优惠码折扣{{item.discountRate}}%
-
免费 ¥{{toDecimal2(item.price)}} {{item.name}} ¥{{ toDecimal2(item.plusPrice) }} 优惠码减免¥{{item.discountMoney}} 优惠码折扣{{item.discountRate}}%
{{item_time_note}} {{ticketText != ''&&item_time_note!=''?'(':''}} 说明:{{ticketText}} {{ticketText != ''&&item_time_note!=''?')':''}}
数量
领券
-
立减{{coupon.couponDiscountMoney}}元
满{{coupon.couponLimitMoney}}减{{coupon.couponDiscountMoney}}
该主办方未认证,请注意风险防范!
互动吧
{{pub_count}}
活动{{fansCount}}
粉丝{{shopDesc|html}}进店 >
Ta组织活动太忙,还没腾出空写简介进店 >
GROMACS是一款功能强大的分子动力学计算软件,开源免费,可扩展性强,计算速度快,主要用于蛋白质、磷脂、核酸等生物体系的模拟,亦可用于聚合物、超分子自组装等非生物体系的大尺度分子动力学计算。支持Amber、CHARMM、GROMOS、OPLS和粗粒化Martini等多种分子力学力场模型。力场和参数文件为纯文本格式,方便用户编辑。同时,集成了多种命令处理输入和输出文件,且所有命令具有近似统一的调用格式,简单易学,吸引了越来越多从事生物分子模拟的科研工作者使用。为了满足更多的学员能够有机会参加学习,我公司将于2019年11月29日~12月1日(共3天)在北京举办“分子动力学模拟GROMACS—初级培训班”欢迎各位老师和同学报名参加!
时间地点:可咨询:13932327338
2019年11月29日~12月1日
地点:北京
报名截止时间:2019年11月24日
本次基础培训班可以为广大GROMACS初学者提供一个良好学习平台,在较短的时间内对分子动力学理论以及GROMACS使用的基础知识进行更有效的掌握,为今后更深一步的分子动力学模拟打下坚实的基础。 所有来参加培训的学员都可以进行上机操作练习,由国家超级计算深圳中心为学员提供充足稳定的测试资源。国家超级计算深圳中心采用曙光6000超级计算系统,每个计算节点由2颗Intel X5650六核心处理器组成、主频2.66GHz,内存48 GB Mem,NV Fermi C2050 GPGPU,QDR IB网络,曙光ParaStor或Lustre并行文件系统。整体计算能力实测峰值为1.271千万亿次浮点运算(1.271PFLOPS)。 第一天 8:00-- 9:00 学员报道,领取资料 9:00-- 11:30 分子模拟简介;分子模拟方法的选择; 分子动力学理论:模拟框架、积分方法、分子力学、力场、系统、常用软件等。 13:00-- 17:00 生物分子的结构搭建和三维可视化 GROMACS的编译/Linux基础/作业提交 GROMACS文件类型、参数设置、top文件详解、模拟流程、分析工具 GROMACS实例展示(纯水体系) 第二天 8:00-- 11:30 GROMACS上机实践1 溶剂体系 完成水和有机溶剂(甲醇和环己烷)的参数设置和模拟,进行温度、密度、偶极矩、介电常数、蒸发焓、扩散系数、径向分布、粘度、表面张力、表面势能等计算分析。 学员在此阶段可学习力场参数的获得、gro和top的准备和修改、标准的分子动力学计算流程、气相和液相体系的模拟设置,以及GROMACS内置的数据分析程序,以及加深对GROMACS文件类型、分子处理、参数设置和关键命令的理解。 13:00-- 17:00 GROMACS上机实践2 蛋白质/蛋白质-配体复合物体系 完成蛋白质、蛋白质/配体在水溶液中的模拟计算,分析蛋白质的柔性、二级结构、亲/疏水面积、回旋半径、蛋白质/配体的结合能、距离、氢键、静电和范德华作用等分析,同时尝试对氨基酸进行突变或修饰,并利用Discovery Studio Visualizer制作高质量三维结构图片。 学员在此阶段可学习GROMACS对蛋白质和配体坐标文件的处理命令,学习利用Amber/CHARMM/GROMOS/OPLS力场构建有机分子(药物、配体、溶剂)的参数,了解软件对混合分子体系(蛋白质/配体/离子/水)的参数设置以及力场文件的修改,掌握GROMACS软件对蛋白质体系的分析程序。 第三天 8:00-- 11:30 GROMACS上机实践3 分子对接与GROMACS优化 利用Autodock Vina软件完成蛋白质-配体复合物的对接,并利用GROMACS进行进一步的结构优化和作用机理分析。 学员在此阶段可学习Autodock Vina刚性和柔性对接的方法,复合物的结构预测及结合能的计算,进一步复习GROMACS软件对蛋白质-配体复合物体系的处理和结果分析。 GROMACS上机实践4 材料相关体系 完成石墨烯、碳纳米管、金属有机骨架材料等体系的力场参数构建和分子模拟。学员在此阶段可学习GROMACS对规则材料和周期性体系的处理。 13:00-- 17:00 GROMACS上机实践5 膜蛋白体系和双相体系 完成膜蛋白体系(蛋白嵌入磷脂双分子层)和双相体系(甲醇/水、环己烷/水,核酸/环己烷/水)的设置和模拟。 学员在此阶段可学习GROMACS对膜蛋白体系、混合溶剂体系、核酸体系的处理和构建以及VMD软件对模拟轨迹文件的可视化,复习混合分子体系参数的设置,学习力场参数文件的获取和手动编辑。 GROMACS上机实践6 粗粒化分子动力学模拟 利用Martini力场完成蛋白质的粗粒化参数设置和模拟,比较全原子力场和粗粒化力场的差异和适用范围。加强学员对GROMACS软件适用范围、mdp和top文件类型的编写、系统平衡、时间步长选择、力场参数选择和构建、出错调试等一系列重要问题的认识。 答疑解惑,互相讨论。
张老师,工学博士,有丰富的GROMACS使用经验,运用GROMACS所做的科研工作已发表在Journal of Physical Chemistry Letter,Journal of Chemical Theory and Computation,Journal of Chemical Information and Modeling等国际学术刊物。 ►培训班费用: (培训班费用不含差旅费、午餐费) 同一单位2人或以上参加,可享受优惠 人员 一人参加 两人及以上 老师 2600元/人 2300元/人 学生 2300元/人 2000元/人
分享到:
微信扫一扫,分享小程序
扫一扫,分享至朋友圈
温馨提示:
在付费报名之前请仔细甄别主办方的资质及服务能力。部分主办方会私下与报名者沟通承诺参与活动后的权益,并夸大参与后的收益效果等,以此来收取高额的报名费。这类活动通常有基于抖音、淘宝等平台的推广、代理加盟、引流变现等相关内容。
为保障您的权益,避免相关的经济损失,互动吧平台特此说明,平台仅提供相关的技术支持,不承担参与者与主办方在活动过程中的相关纠纷,若出现相关纠纷,平台会积极协助处理。
- 为你推荐
-
{{hot.infoStartTime}}
{{hot.infoStartTime}}
{{hot.infoStartTime.substr(0,16).replace(new Date().getFullYear()+'-','')}}
Live{{hot.plusDiscountPriceRange}}{{hot.priceWithSign}} {{hot.highlight|html}}
加载中
该主办方未认证,请注意风险防范!
{{pub_count}}
活动{{fansCount}}
粉丝{{shopDesc|html}}进店>
Ta组织活动太忙,还没腾出空写简介进店>
一对一为您答疑解惑
-
{{selectlist.title}}
{{selectlist.infoDate}}{{selectlist.priceWithSign}} {{selectlist.plusDiscountPriceRange}} {{selectlist.highlight}}
-
{{list.shortName}}天{{list.desc1}}{{list.desc2}}
成为银牌会员
{{infoText}}
-
高端模板免费用
提升活动人气
-
活动排名加权
提升活动排名
-
去除报名页广告
提升活动报名效果
-
高端邀请海报
全场无限使用
-
活动优先审核
快人一步上架曝光
-
大额提现
限额提升4倍
-
报名渠道监测
掌握各渠道业绩
-
发布多场次活动
发布一次一劳永逸
-
免认证服务
免99元审核服务费
-
更多特权
敬请期待
马上开通
-
{{item.type}}
¥{{item.price}}/{{item.viewType}}
¥{{item.oriPrice}}/{{item.viewType}}
季卡、半年卡、年卡均已包含认证审核服务费,支持开具发票
使用微信或支付宝扫码完成支付
支付金额:¥{{selectGrItem.price}}/{{selectGrItem.viewType}}(已省¥{{selectGrItem.oriPrice - selectGrItem.price}})
购买成功
已购买{{orderName}}
支付金额:¥{{payMoney}}
购买商品:{{orderName}}
扫码支付更轻松
购买成功
已购买{{orderName}}
{{curMemberData.title}}
{{curMemberData.tip}}
-
{{item.name}}
查看更多权益>
{{curMemberData.tags[0].name}}
查看更多权益>
{{item.imgText}}
- {{temp.text}}
购买成功
您已成功购买{{checkMemberData.name}}
扫码